El Consejo Asesor tiene por misión vincular al CIIR con el medio externo y realizar recomendaciones estratégicas para conectar el quehacer del Centro con instituciones del sector público, representantes del gobierno, organizaciones del sector privado y la sociedad en general. Esta instancia consultiva está compuesta por las siguientes personas:

Carlos Peña, rector Universidad Diego Portales.
César Millahueique, escritor.
Álvaro Ramis, rector Universidad Academia de Humanismo Cristiano.
Carlos Aldunate, director Museo Chileno de Arte Precolombino.
Pedro Bouchon, vicerrector de investigación Pontificia Universidad Católica de Chile.
María Eugenia Camelio, directora Programa FONDAP- ANID.
Sergio Cubillos, presidente Consejo de Pueblos Atacameños.
Emilio Fernández, académico UTA- director Programa Thakhi.
Yessica Huenteman, diseñadora.